ففي العراق، أدى التوسع السكاني والصناعي في مدينة بغداد والمدن الكبرى، إلى إقامة العديد من المشاريع الصناعية المختلفة المجالات، على نهري دجلة والفرات، والتي تستهلك كميات كبيرة من المياه يومياً، في الوقت الذي ترمى كميات كبيرة من مخلفاتها الصناعية مباشرة إلى النهر من دون أن تمر بمرحلة التنقية والمعالجة. فضلاً عن الفضلات الناتجة من مياه الصرف الصحي الناتجة من الاستعمالات المنزلية. إن وجود مواد مضرة بكميات قليلة ناتجة من هذه المصانع تضخ إلى النهر مباشرة، لا تعطي المياه صفة التلوث، إلا أن تراكم هذه المواد ولمدة طويلة يشكل خطراً على نوعية المياه وبيئتها، وعلى الأسماك والكائنات الأخرى. ما يجعل من التلوث المائي في هذه الحالة مشكلة معقدة وبالغة الخطورة. ومما يدل على تلوث المياه بشكل عام، هو قلة الأوكسجين المذاب أو زيادته، وزيادة المغذيات الذائبة، وزيادة كدرة المياه وتأثيرها على تخلل الضوء، بالإضافة إلى تغير في خواص القاع وزيادة في درجة حرارة المياه، ناهيك عن نمو مفرط لأنواع معينة من الأحياء المائية، كما تكون المياه الملوثة مصدراً للأوبئة والأمراض.

وهنالك عدة أنواع من تلوث المياه، ومنها التلوث الصناعي الناتج عن بعض المصانع العراقية. فمثلاً تستقبل شبكة المياه والمجاري يومياً كميات كبيرة من هذه الفضلات وشبكة مجاري بغداد/ الرصافة تتصل اعتيادياً بمشروع معالجة المياه الثقيلة في الرستمية، الواقع على نهر ديالى. وبالرغم من وجود بعض الأساليب ذات القابلية المحدودة في المعالجة، إلا أنها لا تتضمن التخلص من العناصر الثقيلة قبل أن تطرح إلى النهر، كما أن (50%) من المياه التي يستلمها المشروع، لا تتم معالجتها بسبب محدودية كفاءته. وقد تمت دراسة تركيز عدد من المعادن الثقيلة من قبل الباحث (أزور نعمان)، والمعزولة بالقرب من مصب مشروع الرستمية في نهر ديالى، مثل الكادميوم، النحاس، المنغنيز، الرصاص، والزنك، على عدة أنواع من الأسماك، ومنها سمك الطويني، ووجد أن التراكم الحيوي لهذه المعادن عال جدا في أجسامها، ما يؤدي إلى تسممها، والتي قد تنتقل إلى الإنسان عبر السلسلة الغذائية. فضلاً عن ذلك، فان قناة الجيش تصب مياهها في المنطقة نفسها تقريباً، حاملة الكثير من الفضلات المنزلية. وتحوي هذه الفضلات عند عدم معالجتها، على المواد العضوية كالدهون والكربوهيدرات والبروتينات، وبعض المواد العالقة التي تعمل على استهلاك الأوكسجين المذاب في الماء نتيجة لحدوث تفاعلات المواد العضوية وتفككها، فيزداد بذلك الطلب الحيوي على الأوكسجين، مما يحرم الأحياء المائية منه. كما انها تحتوي على الأملاح المغذية، كأملاح الفوسفات والنترات التي تؤدي زيادة تركيزها إلى ظاهرة الإثراء الغذائي، وهي حالة ازدهار الماء بالطحالب والنباتات بشكل كثيف، مما يؤدي إلى اخضرار لون الماء وازرقاقه. كما أن زيادة المواد العضوية المطروحة في مياه الصرف الصحي، تشجع على تلوثها بعدد من الأحياء الدقيقة، كالبكتريا والفطريات والفيروسات، أو ما يدعى مجازاً بفطريات المجاري، والتي تلوث الأحياء المائية وتشجع على انتقال الأمراض السارية كالتيفوئيد والكوليرا والبلهارزيا والدزنتري، حيث تكون فضلات المجاري مكاناً جيدا لنموها. وتحوي مياه الصرف الصحي في هذه المنطقة على المنظفات، كالمنظفات الصناعية المتأينة السالبة، وهي الأكثر استعمالاً، والتي تكون صعبة التحلل وسامة للأسماك، إضافة إلى المنظفات غير المتأينة، التي في حال عدم تكسرها حيوياً فأنها تؤدي إلى تكون الرغوة في المياه، مما يتداخل مع كمية الأوكسجين المذاب، بالرغم من عدم سميتها للأسماك بشكل مباشر، ولكنها تمنع عمل البكتريا في محطات التنقية البايولوجية للمياه الثقيلة..