على الرغم من انها تعاني من بعض الحركات الانفصالية في بعض مقاطعتها، وسكانها يتجاوزون الـ 270 مليون نسمة، الا ان تعداد القوات المسلحة الاندونيسية لم يتجاوز الـ 300000 عنصر أندونيسي وهي بمجملها قوات بحرية بحكم طبيعة البلاد المؤلفة من ارخبيل واسع من الجزر التي تحيط بها المياه من كل جانب،
 الى جانب بضعة الاف من قوات المارينز وقوة جوية متكاملة. وتنفق اندونيسيا على جيشها وسلاح الجو حوالي 4% من الناتج المحلي، وعانت الى وقت قريب من الحركات الانفصالية في مقاطعتي اتشي وبابوا، حيث وقعت مواجهات دامية استمرت طويلا، لكن تم التوصل إلى اتفاق لوقف إطلاق النار في عام 2005 في بابوا، حيث تراجعت مستويات العنف وانتهاكات حقوق الإنسان، منذ رئاسة سوسيلو بامبانج يودويونو.